二十世纪初的日本太正时代，自明治维新以来的文明开化已进行了五十余年。随着西洋文化和日本传统文化的交汇融合，帝都·东京逐渐成为现代化建筑鳞次栉比，蒸汽铁道ã€地下铁道纵横交错，马车ã€人力车ã€蒸汽车川流不息的繁华都市。然而，这也是一座有着怪物和咒术等非现实存在的魔幻都市。为了对抗从地底出现的强大魔物“降魔â€ï¼Œ陆军成立了由将校中的灵能者组成的特殊部队——对降魔部队，成员即“二刀二剑â€的4位继承者：米田一基，持有 “神刀·灭却â€ï¼›山崎真之介，持有“光刀·无形â€ï¼›藤枝菖蒲，持有“神剑·白羽鸟â€ï¼›真宫寺一马，持有“灵剑·荒鹰â€ã€‚四人仅凭自己的血肉之躯和手中的神剑与魔物作战，史称“降魔战争â€ã€‚激战的结果，陷入绝境的对降魔部队被迫使出最后的手段——利用“魔神器â€发动“破邪之血â€ã€‚魔神器即日本上古时代流传下来的三种祭器：剑ã€珠ã€玉，可以成为魔力的增幅器。继承真宫寺家“破邪之血â€的一马，以自己的生命为代价用魔神器将降魔们封印，而山崎真之介也在此战中失踪……太正十一年，以妖僧天海为首的邪恶组织“黑之巢会â€蠢蠢欲动。仇视近代文明的天海为了复辟德川幕府的统治，率领手下的死天王葵叉丹ã€弥勒ã€修罗ã€罗刹，操纵着利用古代咒法生出的魔物——魔操机兵在帝都展开了破坏活动。为了对抗这新的威胁ã€守护帝都和民众，在花小路伯爵的大力支持下，新的政府直属对降魔组织——帝国华击团（简称“帝击â€ï¼‰Â·花组成立了。在米田一基ã€藤枝菖蒲的领导下，花组集结了6名具备高灵力的少女：真宫寺一马的女儿ã€灵剑·荒鹰的继承者真宫寺樱ï¼›神崎财阀总帅忠义的孙女ã€精通神崎风尘流长刀术的神崎堇ï¼›俄国革命的勇士ã€曾有“食火鸟â€之称的玛丽亚·橘ï¼›自幼就因超常的灵力被与世隔绝ã€年仅10岁的法国贵族千金爱丽丝ï¼›在辛亥革命的战乱中失去亲人ã€精通机械的中国少女李红兰ï¼›以及桐岛流空手的正统传人ã€身高近 2米的桐岛神奈。同时，基于山崎真之介留下的设计，由神崎重工完成了对降魔用灵子甲胄“光武â€ã€‚以银座大帝国剧场为基地ã€平日以歌剧团面目出现来掩人耳目的花组，在魔物出现时就会变为守护帝都的战士，驾驶光武与敌人作战。太正十二年春，苦于战力及协作性不足的花组来了一位新队长——海军少尉大神一郎，《樱花大战》的故事也就从这里开始了……
